L’aprovació de les bases per fer arribar els fons nuclears al sector privat ha comptat amb un ampli consens dels representants presents a l’organisme de governança dels fons. Les discrepàncies s’han focalitzat, segons han reconegut diverses fonts, en la delegació a l’Institut per al Desenvolupament de les Comarques de l’Ebre (IDECE) de les competències de secretaria tècnica. La secretaria tècnica hauria de donar assessorament als ajuntaments i empreses per tal d’optar als fons.
La proposta de què aquesta funció la desenvolupe l’IDECE, com un organisme que depén d’Empresa i Treball, ha rebut el recel d’algunes alcaldies, sobretot del Camp de Tarragona, que veuen l’IDECE com un organisme exclusivament de les Terres de l’Ebre i que podria anar en contra dels interessos d’alguns municipis de l’àrea de Vandellòs. Malgrat que encara no s’ha pres la decisió definitiva, el secretari d’Empresa i Treball, Albert Castellanos, ha destacat que l’IDECE “és l’organisme més adient” per a desenvolupar aquesta funció, tot i que ha reconegut que “no és perfecte”.